26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1401 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  100 
 
 
98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  45.19 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  41.18 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  44.9 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  40.62 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  38.14 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  36.73 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  39.22 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  35 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  34.95 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0010  hypothetical protein  37.62 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.409313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  30.21 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  31.43 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  25.93 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  29.25 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  27.36 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  25.49 
 
 
105 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  25.24 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1307  hypothetical protein  46.15 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0303736  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  27.88 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  26.42 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  26.42 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  26.21 
 
 
106 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  24.04 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  26.36 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>