52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0189 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  222  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  78.7 
 
 
108 aa  183  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  78.7 
 
 
108 aa  183  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  54.63 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  54.21 
 
 
107 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  55.14 
 
 
107 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  53.21 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  54.21 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  53.27 
 
 
107 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  52.78 
 
 
106 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  49.07 
 
 
106 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  46.3 
 
 
106 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  50.45 
 
 
105 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  45.37 
 
 
106 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  48.65 
 
 
106 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  37.04 
 
 
105 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  41.28 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  34.26 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  39.45 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  38.18 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  36.94 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  40.18 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  34.26 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  35.51 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  35.51 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  39.09 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  39.81 
 
 
98 aa  57.8  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  38.32 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  38.32 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  26.42 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  28.97 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  36.97 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  32.41 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  28.97 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  30.19 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3956  hypothetical protein  32.43 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  27.62 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  29.25 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  26.17 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  27.36 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  27.1 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>