32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0077 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  220  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  39 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  40.95 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  37.62 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  35.78 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  37.61 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0010  hypothetical protein  40.57 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.409313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  34.95 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  34.62 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  31.07 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  30.1 
 
 		 105 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1307  hypothetical protein  55.36 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0303736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  32.67 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  29.36 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  28.85 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  27.62 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  28.85 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  32.11 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  28.3 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  29.2 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  28.3 
 
 		 108 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  29.81 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  26.92 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  26.92 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  28.83 
 
 		 111 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  31.78 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  31.78 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>