32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0039 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  216  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  36.61 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  34.91 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  33.98 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  32.43 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  34.58 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  36.45 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  35.19 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  29.81 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  32.32 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  29.63 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  29.63 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  32.17 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  38.68 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  32.14 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  26.67 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  31.13 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  32.73 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  30.19 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  31.43 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  32.41 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  31.78 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  34.21 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  35.45 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  32.04 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  29.25 
 
 		 106 aa  42  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  35.45 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  31.13 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  26.13 
 
 		 105 aa  40.8  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  24.07 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>