42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0432 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  99.07 
 
 
107 aa  216  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  91.59 
 
 
107 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  91.59 
 
 
107 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  91.59 
 
 
140 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  91.59 
 
 
107 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  90.65 
 
 
107 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  90.65 
 
 
107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  89.72 
 
 
107 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  60.75 
 
 
108 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  60.75 
 
 
108 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  55.14 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  50.93 
 
 
106 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  50.93 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  45.95 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  44.55 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  44.44 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  46.36 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  42.73 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  44.55 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  39.62 
 
 
107 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  32.38 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  36.7 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  32.04 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  32.46 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  35.19 
 
 
107 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  31.82 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  30.91 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  31.82 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  31.82 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  25.71 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  30.28 
 
 
98 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  34.19 
 
 
114 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  26.67 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>