11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1670 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  59.09 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5445  SPW repeat protein  39.86 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.488563  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10189  transmembrane protein  39.37 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.115574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  36.63 
 
 		 120 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  28.7 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  29.29 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  32.26 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  35.16 
 
 		 121 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  31.5 
 
 		 830 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  30.56 
 
 		 121 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>