16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2330 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  58.68 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  57.85 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  37.36 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  35.85 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  40.86 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  36.54 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  36.56 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  37 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  29.29 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  32.71 
 
 		 125 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  37.8 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  32.38 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2216  hypothetical protein  30.23 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753483  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10189  transmembrane protein  30.69 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.115574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  29.2 
 
 		 115 aa  40  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>