19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3806 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  228  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  42.86 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  48.42 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  44.9 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  38.24 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  38.05 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  40.4 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3684  hypothetical protein  42.55 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.433876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  37.62 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  44.58 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  34.91 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2216  hypothetical protein  31.87 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  31.63 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10189  transmembrane protein  37.76 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.115574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  33.63 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2627  SPW repeat-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0437  SPW repeat-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>