15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3604 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  58.68 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  58.68 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  44.58 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  44.09 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  43.88 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  43.9 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  28.7 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  37.63 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2216  hypothetical protein  32.91 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  32.38 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  33.03 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  32.88 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  31.31 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>