17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4779 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  100 
 
 		 121 aa  241  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  57.85 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  58.68 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  43.48 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  46.24 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  34.55 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  41.94 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  30.21 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2216  hypothetical protein  35.53 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  40.74 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  35.04 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  33.67 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  35.48 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10189  transmembrane protein  31.19 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.115574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  35.62 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5445  SPW repeat protein  37.76 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.488563  normal  0.725666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>