14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4411 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  35.25 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  39.67 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  28.69 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  36.73 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  38.39 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  39.22 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  36.21 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  32.71 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  34.38 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3684  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.433876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2216  hypothetical protein  26.83 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>