14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1731 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  256  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  42.98 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  46.59 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  31.4 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  37.04 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  33.96 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  33.91 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  38.04 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  33.03 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  32.38 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3684  hypothetical protein  32.09 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.433876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5445  SPW repeat protein  27.62 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.488563  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  37.35 
 
 		 121 aa  40  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>