21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2143 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  100 
 
 		 120 aa  221  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  57.14 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  46.61 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  45.65 
 
 		 118 aa  90.5  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  41.53 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  41.44 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  42.98 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  38.28 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  42.06 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  44.09 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  39.62 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  36.63 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  33.67 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  43.84 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3684  hypothetical protein  32.8 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.433876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10189  transmembrane protein  38.46 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.115574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2627  SPW repeat-containing protein  36.94 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.849489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0521  hypothetical protein  60 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2216  hypothetical protein  25.84 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753483  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0437  SPW repeat-containing protein  35.96 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3824  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.373071  normal  0.118455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>