17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3147 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3147  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  227  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2143  SPW repeat-containing protein  57.66 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3806  hypothetical protein  44.55 
 
 		 118 aa  86.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2698  SPW repeat protein  47.93 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8351  SPW repeat-containing protein  46 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0406  SPW repeat-containing protein  44.04 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4411  hypothetical protein  40.16 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0776  hypothetical protein  39.82 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000839757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3604  hypothetical protein  43.88 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00421282  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1731  hypothetical protein  37.04 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2330  hypothetical protein  40.86 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10189  transmembrane protein  38.53 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.115574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1670  SPW repeat-containing protein  35.16 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.39773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4779  SPW repeat-containing protein  46.84 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0479047  normal  0.168219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1639  SPW repeat-containing protein  31.63 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.497471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3684  hypothetical protein  36.67 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.433876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2627  SPW repeat-containing protein  35.96 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.849489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>