More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0298 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0298  amidotransferase  100 
 
 
606 aa  1232    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3265  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  48.44 
 
 
614 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0134  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  46.49 
 
 
618 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2428  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  44.04 
 
 
555 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0680339  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  42.83 
 
 
629 aa  482  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0183361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1965  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  42.69 
 
 
607 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2520  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.07 
 
 
620 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0134172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0683  asparagine synthase  42.83 
 
 
582 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.62 
 
 
628 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.42 
 
 
629 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.62 
 
 
638 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.4 
 
 
639 aa  223  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.41 
 
 
629 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.52 
 
 
639 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.84 
 
 
634 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.8 
 
 
619 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.96 
 
 
641 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2327  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.66 
 
 
629 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.752356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.21 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3988  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.4 
 
 
656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.09 
 
 
643 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2466  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
625 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  32.09 
 
 
643 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.52 
 
 
635 aa  210  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0668  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.89 
 
 
651 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.223123  normal  0.798574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5373  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.12 
 
 
676 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2172  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.27 
 
 
665 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.71793  hitchhiker  0.0000206838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4005  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.71 
 
 
622 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.09 
 
 
633 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.96 
 
 
637 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.64 
 
 
658 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  30.8 
 
 
637 aa  204  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.22 
 
 
654 aa  203  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2519  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.09 
 
 
647 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.828783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3272  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  30.22 
 
 
642 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.95 
 
 
632 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0793  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.98 
 
 
639 aa  200  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.716028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.84 
 
 
623 aa  199  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5624  putative asparagine synthetase  30.44 
 
 
656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622425  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0138  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.84 
 
 
631 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0809158  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3121  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.88 
 
 
641 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0858  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.42 
 
 
655 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.57 
 
 
637 aa  193  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3175  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  28.63 
 
 
643 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2615  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.19 
 
 
637 aa  190  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.665641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3228  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.92 
 
 
653 aa  190  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4439  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.66 
 
 
634 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2388  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.85 
 
 
627 aa  187  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.13 
 
 
646 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.78 
 
 
655 aa  187  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1636  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.87 
 
 
643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.236988  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0146  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.57 
 
 
652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.24 
 
 
631 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0596  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.78 
 
 
630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1548  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.23 
 
 
647 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545574  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2639  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.64 
 
 
647 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1749  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.59 
 
 
656 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4217  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.17 
 
 
655 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.38 
 
 
627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4740  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.1 
 
 
655 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1158  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.04 
 
 
656 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.433093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2247  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.04 
 
 
656 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0082  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.04 
 
 
656 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0918  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.04 
 
 
656 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1535  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.04 
 
 
656 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2478  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.62 
 
 
660 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.669542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1004  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.66 
 
 
656 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.951042  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5441  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.18 
 
 
656 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277238  normal  0.0334078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  29 
 
 
606 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0508  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  25.84 
 
 
626 aa  177  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04798  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.48 
 
 
646 aa  177  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4843  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.81 
 
 
656 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0921814  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3523  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.81 
 
 
656 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.848758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1275  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.03 
 
 
650 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.157776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.6 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1353  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.64 
 
 
632 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.1901  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3607  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  25.58 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2360  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.26 
 
 
619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0446354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.36 
 
 
601 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3348  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 
643 aa  173  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  28.39 
 
 
629 aa  173  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  27.51 
 
 
590 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  27.17 
 
 
590 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.51 
 
 
600 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.22 
 
 
590 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.79 
 
 
635 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.45 
 
 
589 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.65 
 
 
601 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.65 
 
 
601 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.65 
 
 
601 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.73 
 
 
625 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  23.18 
 
 
634 aa  170  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.68 
 
 
633 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.46 
 
 
598 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  27.89 
 
 
595 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.55 
 
 
632 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.19 
 
 
595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  27.19 
 
 
595 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  28.44 
 
 
590 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  27.61 
 
 
589 aa  167  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>