83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0028 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0028  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00019483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  89.09 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0023  tRNA-Val  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0018  tRNA-Val  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0123  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0167093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0103  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727228  decreased coverage  0.000000214334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0117  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.196066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0116  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.145812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0026  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000193021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0089  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0017  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000587442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0016  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0016  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0122  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00712397  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0027  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0124  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000273434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0123  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000571932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0017  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0114  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000342233  normal  0.573602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0142  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0141  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.122826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0048  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000100606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0038  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000899293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0130  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0131  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0144  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0046  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000453767  hitchhiker  0.0000828502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0142  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0143  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00160739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0027  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00246876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0028  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00514358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0117  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000471019  normal  0.0136219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0053  tRNA-Val  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t024  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t097  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t098  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0021  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000217303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00039101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0087  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223342  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0023  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000214609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0046  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000279997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0117  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000010533  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0134  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000115424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0135  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000102707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0020  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0021  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.29162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.281801  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0087  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0022  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0023  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0042  tRNA-Val  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t001  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t098  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000663033  normal  0.0932756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t107  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0072  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.593319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0001  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.436716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0586  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00782572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.1136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738285 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000344573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0060  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000213973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>