More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0818 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0818  ribosomal protein L31  100 
 
 
76 aa  158  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000168077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 
75 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  60 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
66 aa  83.6  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  58.46 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 
72 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  57.81 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  56 
 
 
75 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  55.41 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
65 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  56.92 
 
 
68 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
66 aa  80.5  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
65 aa  80.5  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
66 aa  80.5  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 
75 aa  80.1  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
67 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  56.52 
 
 
74 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 
66 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
67 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
72 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
72 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  56.34 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  52.24 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  52.24 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  50 
 
 
71 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  52.17 
 
 
74 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  49.23 
 
 
74 aa  76.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  51.47 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  51.95 
 
 
75 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  51.95 
 
 
75 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 
68 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  48.48 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1109  ribosomal protein L31  55.22 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  59.7 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  52.24 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  53.73 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  52.24 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
71 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 
71 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  54.93 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
66 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  53.03 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  45.33 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  46.97 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  0.0000489926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 
70 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 
70 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  46.67 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  50.77 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  61.02 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  45.59 
 
 
70 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  47.76 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  43.28 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  47.3 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  46.27 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  43.08 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  49.23 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 
70 aa  70.1  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1303  50S ribosomal protein L31  57.63 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  46.97 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  46.58 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5136  ribosomal protein L31  47.69 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  47.69 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  46.97 
 
 
70 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  51.56 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  49.28 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  46.67 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  47.06 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  48.53 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  49.25 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  49.25 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  50.82 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  50.62 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  45.59 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>