18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1435 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  167  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  47.37 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  50.63 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  51.9 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  44.87 
 
 
80 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  43.75 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  43.42 
 
 
79 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  34.62 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  36.14 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  33.73 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  33.77 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2388  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191336  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0066  hypothetical protein  37.97 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.859695  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  43.64 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  32.47 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  37.04 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1934  hypothetical protein  32.79 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.775728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  29.51 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>