21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0810 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  79.49 
 
 
80 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  48.1 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  44.87 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  41.03 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  43.04 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  41.03 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  39.02 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  43.59 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  39.24 
 
 
78 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  39.74 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  32.56 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2642  hypothetical protein  39.71 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  43.64 
 
 
56 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1934  hypothetical protein  31.03 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.775728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  31.58 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2388  hypothetical protein  37.18 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191336  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0485  hypothetical protein  30.12 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  normal  0.844961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>