20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4104 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  164  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  52.63 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  47.44 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  45 
 
 		 81 aa  69.3  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  41.56 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  32.91 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  34.15 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  38.16 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  32.91 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  35.9 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  43.64 
 
 		 56 aa  52  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  32.89 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1934  hypothetical protein  36.71 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.775728  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2388  hypothetical protein  40 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4994  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439172  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  27.71 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2642  hypothetical protein  31.34 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>