18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4038 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  48.75 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  48.1 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  47.5 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  41.25 
 
 
78 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  42.5 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  45 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  43.75 
 
 
81 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  41.25 
 
 
79 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  37.65 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  37.35 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  28.75 
 
 
78 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  42.5 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2642  hypothetical protein  41.43 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  38.18 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  46.51 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  35 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>