21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1042 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  165  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  60.26 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  58.44 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  53.25 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  41.25 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  37.5 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2200  hypothetical protein  94.29 
 
 		 44 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 42 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  31.58 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  38.16 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  35.53 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  31.33 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  38.16 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  35.44 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  36.36 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2642  hypothetical protein  35.94 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  31.17 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4994  hypothetical protein  30.56 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439172  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>