17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3146 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  51.95 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  50.65 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  60.26 
 
 
79 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  43.04 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  41.25 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  39.74 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  43.42 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  35.9 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  38.46 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  32.47 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  35.44 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  33.73 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2201  hypothetical protein  72.5 
 
 
42 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  34.55 
 
 
56 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2642  hypothetical protein  34.33 
 
 
71 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>