16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1210 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  174  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  50.62 
 
 
106 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  37.8 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  39.02 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  38.1 
 
 
80 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  34.15 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  34.88 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  36.25 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  34.57 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  37.35 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  35 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  36.14 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  35.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4994  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439172  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  32.5 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  32.76 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>