19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2821 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  164  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  37.8 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  35.8 
 
 
80 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  39.24 
 
 
80 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  38.96 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  34.62 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  32.91 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2604  hypothetical protein  35.06 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55394  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  29.11 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  32.47 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  28.75 
 
 
81 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  40.26 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  26.32 
 
 
78 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1776  hypothetical protein  30.36 
 
 
56 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.22868  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  26.32 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4994  hypothetical protein  35.44 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439172  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0243  hypothetical protein  27.71 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000609529  hitchhiker  0.000000039136 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0485  hypothetical protein  27.16 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1042  hypothetical protein  32 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>