18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1934 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.775728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3434  hypothetical protein  42.5 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3624  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4104  hypothetical protein  38.36 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.400852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0810  hypothetical protein  35.9 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4572  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1435  hypothetical protein  34.18 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0057  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4994  hypothetical protein  42.68 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.439172  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2642  hypothetical protein  32.86 
 
 		 71 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4038  hypothetical protein  32.91 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0392146 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1210  hypothetical protein  28.92 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3484  hypothetical protein  32.89 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3146  hypothetical protein  33.85 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.020034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.605649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0066  hypothetical protein  31.82 
 
 		 92 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.859695  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2388  hypothetical protein  29.85 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0950  hypothetical protein  34.21 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>