37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0421 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0421  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.320251  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0838  hypothetical protein  70.47 
 
 
195 aa  295  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1845  hypothetical protein  55.96 
 
 
199 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3714  hypothetical protein  52.82 
 
 
196 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2672  hypothetical protein  53.93 
 
 
192 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2373  hypothetical protein  52.11 
 
 
196 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.795267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2096  hypothetical protein  52.63 
 
 
193 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4114  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  204  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1108  hypothetical protein  53.93 
 
 
194 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.135208  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2279  hypothetical protein  48.42 
 
 
193 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0781006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3720  hypothetical protein  47.89 
 
 
193 aa  187  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5543  hypothetical protein  47.89 
 
 
193 aa  187  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4922  hypothetical protein  47.89 
 
 
193 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0138897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2489  hypothetical protein  47.12 
 
 
193 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0921  hypothetical protein  47.12 
 
 
193 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.541802  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0270  hypothetical protein  46.6 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.836595  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1647  hypothetical protein  46.6 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.559151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0302  hypothetical protein  46.6 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1450  hypothetical protein  46.6 
 
 
193 aa  184  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2627  hypothetical protein  47.12 
 
 
193 aa  184  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0540  hypothetical protein  47.64 
 
 
193 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.357935  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4546  hypothetical protein  46.32 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3707  hypothetical protein  46.32 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3817  hypothetical protein  46.32 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3640  hypothetical protein  39.2 
 
 
197 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000155227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2200  hypothetical protein  34.38 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.859011  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0813  hypothetical protein  35.08 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0319296 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0897  hypothetical protein  29.17 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0814  hypothetical protein  32.82 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0767  hypothetical protein  32.31 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.934499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0818  hypothetical protein  31.79 
 
 
186 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3110  hypothetical protein  30.81 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181595  normal  0.207349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1808  hypothetical protein  30.94 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169561  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5319  hypothetical protein  25.86 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0060  hypothetical protein  22.63 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0232574  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0455  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 
188 aa  58.9  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0294  hypothetical protein  28.23 
 
 
168 aa  55.1  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>