37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3640 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3640  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000155227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0421  hypothetical protein  39.2 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.320251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4114  hypothetical protein  41.97 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0838  hypothetical protein  38.07 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2672  hypothetical protein  38.22 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2373  hypothetical protein  37.95 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.795267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3714  hypothetical protein  38.02 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1108  hypothetical protein  37.75 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.135208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1845  hypothetical protein  37.36 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3720  hypothetical protein  38.67 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5543  hypothetical protein  40.12 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0270  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0302  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2627  hypothetical protein  36.98 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.559151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1450  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3707  hypothetical protein  42.28 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4546  hypothetical protein  42.28 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3817  hypothetical protein  42.28 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2489  hypothetical protein  36.98 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0921  hypothetical protein  36.98 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.541802  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4922  hypothetical protein  41.33 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0138897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2096  hypothetical protein  36.02 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2279  hypothetical protein  40.94 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0781006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0540  hypothetical protein  37.82 
 
 		 193 aa  94.4  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.357935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1808  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169561  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0897  hypothetical protein  30.37 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3110  hypothetical protein  31.79 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181595  normal  0.207349 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0455  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2200  hypothetical protein  30.21 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.859011  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5319  hypothetical protein  25.52 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0294  hypothetical protein  30.77 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0813  hypothetical protein  34.97 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0767  hypothetical protein  36.24 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.934499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0814  hypothetical protein  36.24 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0818  hypothetical protein  36.24 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0060  hypothetical protein  28.7 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0232574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>