37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3110 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181595  normal  0.207349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1808  hypothetical protein  70.2 
 
 		 203 aa  284  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169561  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2200  hypothetical protein  36.81 
 
 		 191 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.859011  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0838  hypothetical protein  32.43 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4114  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.795267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0421  hypothetical protein  30.81 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.320251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5543  hypothetical protein  33.88 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3714  hypothetical protein  31.15 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3720  hypothetical protein  33.94 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2096  hypothetical protein  34.78 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1108  hypothetical protein  31.38 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.135208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2672  hypothetical protein  31.69 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3640  hypothetical protein  31.79 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000155227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0540  hypothetical protein  33.73 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.357935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2489  hypothetical protein  31.95 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0921  hypothetical protein  31.95 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.541802  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1647  hypothetical protein  31.36 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.559151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0270  hypothetical protein  31.36 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0302  hypothetical protein  31.36 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2279  hypothetical protein  32.12 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0781006 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1450  hypothetical protein  31.36 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4922  hypothetical protein  30.6 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0138897 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1845  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2627  hypothetical protein  31.36 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0897  hypothetical protein  22.99 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3707  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4546  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3817  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0814  hypothetical protein  31.35 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0767  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.934499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0818  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0294  hypothetical protein  28.9 
 
 		 168 aa  72  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0455  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0813  hypothetical protein  39.56 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5319  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0060  hypothetical protein  24.85 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0232574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>