37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5543 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5543  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3720  hypothetical protein  98.44 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2279  hypothetical protein  92.75 
 
 		 193 aa  362  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0781006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3707  hypothetical protein  92.23 
 
 		 193 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3817  hypothetical protein  92.23 
 
 		 193 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4546  hypothetical protein  92.23 
 
 		 193 aa  360  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4922  hypothetical protein  90.67 
 
 		 193 aa  358  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0138897 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0921  hypothetical protein  76.56 
 
 		 193 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.541802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2489  hypothetical protein  76.56 
 
 		 193 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0270  hypothetical protein  76.04 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0302  hypothetical protein  76.04 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1647  hypothetical protein  76.04 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.559151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1450  hypothetical protein  76.04 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2627  hypothetical protein  76.04 
 
 		 193 aa  297  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0540  hypothetical protein  75 
 
 		 193 aa  290  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.357935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4114  hypothetical protein  68.75 
 
 		 193 aa  271  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2672  hypothetical protein  62.94 
 
 		 192 aa  241  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1845  hypothetical protein  59.47 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3714  hypothetical protein  57.73 
 
 		 196 aa  224  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2373  hypothetical protein  55.9 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.795267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2096  hypothetical protein  57.14 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1108  hypothetical protein  55.26 
 
 		 194 aa  201  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.135208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0838  hypothetical protein  51.58 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0421  hypothetical protein  47.89 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.320251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2200  hypothetical protein  37.78 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.859011  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3640  hypothetical protein  40.12 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000155227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1808  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169561  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0897  hypothetical protein  28.27 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3110  hypothetical protein  33.88 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181595  normal  0.207349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5319  hypothetical protein  29.59 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0818  hypothetical protein  30.16 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0814  hypothetical protein  29.63 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0767  hypothetical protein  30.16 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.934499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0813  hypothetical protein  29.26 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0455  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0294  hypothetical protein  30.33 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0060  hypothetical protein  28.32 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0232574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>