37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3714 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3714  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2373  hypothetical protein  83.08 
 
 
196 aa  345  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.795267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2672  hypothetical protein  72.25 
 
 
192 aa  302  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2096  hypothetical protein  68.95 
 
 
193 aa  280  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2279  hypothetical protein  58.76 
 
 
193 aa  228  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0781006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0421  hypothetical protein  52.82 
 
 
201 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.320251  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5543  hypothetical protein  57.73 
 
 
193 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3707  hypothetical protein  57.73 
 
 
193 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4546  hypothetical protein  57.73 
 
 
193 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3817  hypothetical protein  57.73 
 
 
193 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4114  hypothetical protein  58.42 
 
 
193 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3720  hypothetical protein  57.51 
 
 
193 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4922  hypothetical protein  56.92 
 
 
193 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0138897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2489  hypothetical protein  54.21 
 
 
193 aa  217  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0921  hypothetical protein  54.21 
 
 
193 aa  217  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.541802  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1450  hypothetical protein  53.68 
 
 
193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1647  hypothetical protein  53.68 
 
 
193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.559151  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0270  hypothetical protein  53.68 
 
 
193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0302  hypothetical protein  53.68 
 
 
193 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1845  hypothetical protein  56.4 
 
 
199 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2627  hypothetical protein  53.68 
 
 
193 aa  214  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0540  hypothetical protein  53.16 
 
 
193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.357935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0838  hypothetical protein  53.12 
 
 
195 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1108  hypothetical protein  52.36 
 
 
194 aa  195  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.135208  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3640  hypothetical protein  38.02 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000155227 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0897  hypothetical protein  32.81 
 
 
194 aa  106  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2200  hypothetical protein  32.63 
 
 
191 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.859011  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1808  hypothetical protein  32.97 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169561  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3110  hypothetical protein  31.15 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181595  normal  0.207349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0813  hypothetical protein  27.23 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0319296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0767  hypothetical protein  25.65 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.934499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0814  hypothetical protein  25.13 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0818  hypothetical protein  24.61 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5319  hypothetical protein  25.91 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0294  hypothetical protein  27.2 
 
 
168 aa  58.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0455  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0060  hypothetical protein  21.23 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0232574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>