37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1808 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1808  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  403  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169561  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3110  hypothetical protein  70.2 
 
 
198 aa  284  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181595  normal  0.207349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2200  hypothetical protein  35.91 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.859011  normal  0.0208596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4922  hypothetical protein  35.71 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0138897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5543  hypothetical protein  37.7 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4114  hypothetical protein  37.84 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3720  hypothetical protein  36.96 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2279  hypothetical protein  36.26 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0781006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3640  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000155227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1845  hypothetical protein  32.97 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3714  hypothetical protein  32.97 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4546  hypothetical protein  34.15 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3817  hypothetical protein  34.15 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3707  hypothetical protein  34.15 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0838  hypothetical protein  32.97 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2373  hypothetical protein  32.61 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.795267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2672  hypothetical protein  32.93 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2096  hypothetical protein  34.78 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.2315 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0921  hypothetical protein  32.52 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.541802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2489  hypothetical protein  32.52 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0421  hypothetical protein  30.94 
 
 
201 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.320251  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0302  hypothetical protein  31.9 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1647  hypothetical protein  31.9 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.559151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1450  hypothetical protein  31.9 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0270  hypothetical protein  31.9 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.836595  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2627  hypothetical protein  31.9 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0897  hypothetical protein  24.44 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0540  hypothetical protein  32.52 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.357935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1108  hypothetical protein  31.35 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.135208  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0767  hypothetical protein  31.72 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.934499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0814  hypothetical protein  32.26 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0818  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0813  hypothetical protein  44.71 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0319296 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0455  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0294  hypothetical protein  26.04 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0060  hypothetical protein  30.26 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0232574  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5319  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>