24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2525 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2525  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1163    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  25.66 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  26.2 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  23.08 
 
 		 618 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  23.25 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  28.17 
 
 		 507 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  22.22 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  20.74 
 
 		 629 aa  55.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.12 
 
 		 758 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  21.95 
 
 		 671 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  25.27 
 
 		 833 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  24.13 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1179 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  22.35 
 
 		 824 aa  48.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 826 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  25.82 
 
 		 841 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  36.49 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  28.57 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  27.16 
 
 		 823 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  27.41 
 
 		 662 aa  44.3  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  33.85 
 
 		 617 aa  43.9  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  25.44 
 
 		 837 aa  43.9  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  25 
 
 		 442 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  25.39 
 
 		 442 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>