More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1349 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1349  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 344 aa  689    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0739  rod shape-determining protein MreB  60.74 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.766157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  57.45 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  54.41 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  54.73 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  54.24 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  58.62 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  55.9 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1068  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.15 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  55.96 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  55.05 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  53.67 
 
 		 346 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  56.79 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  53.96 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  53.96 
 
 		 347 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 347 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  53.46 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 		 344 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 		 342 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 344 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  55.45 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  56.31 
 
 		 348 aa  358  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  52.25 
 
 		 342 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  52.54 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  53.71 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  52.74 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  52.16 
 
 		 359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 344 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 344 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.15 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  53.11 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.6 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  53.23 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  53.01 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  52.63 
 
 		 338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  53.05 
 
 		 348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  51.66 
 
 		 343 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  352  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  54.6 
 
 		 342 aa  351  8e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  52.63 
 
 		 358 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  51.94 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  51.79 
 
 		 333 aa  350  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 343 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  54.21 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  55.18 
 
 		 346 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 		 343 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 		 346 aa  350  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.21 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  51.1 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  51.71 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  52.32 
 
 		 339 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.07 
 
 		 344 aa  349  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  52.78 
 
 		 368 aa  348  7e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.75 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  51.88 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  52.65 
 
 		 333 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  52.17 
 
 		 340 aa  345  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  51.04 
 
 		 347 aa  345  7e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  53.58 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 345 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  52.34 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  51.52 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  50.45 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  50.46 
 
 		 343 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  50.63 
 
 		 342 aa  341  8e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  51.91 
 
 		 345 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5077  rod shape-determining protein Mbl  52.34 
 
 		 333 aa  341  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000326742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5404  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000385561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5455  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5128  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4962  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.96321e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4974  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000021016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.71 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5520  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  53.37 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3798  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000087539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5369  rod shape-determining protein Mbl  52.02 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  49.69 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>