15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0073 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0073  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  900    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 543 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 711 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.41 
 
 		 850 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  26.15 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 927 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.07 
 
 		 587 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3209  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.89 
 
 		 234 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00149401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>