11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0229 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0229  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  371  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.318648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3309  hypothetical protein  57.75 
 
 		 188 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1564  hypothetical protein  55 
 
 		 206 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0315452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3623  hypothetical protein  31.75 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.114208  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 		 940 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  27.96 
 
 		 1426 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  25.79 
 
 		 1427 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2888  hypothetical protein  30.4 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.645043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2872  Peptidase M64, IgA  26.29 
 
 		 785 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3363  hypothetical protein  30.43 
 
 		 323 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  24.59 
 
 		 1422 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>