24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0424 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  714    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  76.55 
 
 
361 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  71.39 
 
 
369 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  58.53 
 
 
346 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  58.27 
 
 
346 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  61.11 
 
 
354 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  54.74 
 
 
351 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  54.16 
 
 
339 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  79.56 
 
 
355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  53.66 
 
 
349 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  47.83 
 
 
337 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  50.46 
 
 
318 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  50.72 
 
 
315 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  47.04 
 
 
325 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  48.54 
 
 
378 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  45.87 
 
 
319 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  44.36 
 
 
329 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 
329 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  23.2 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  22.64 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  23.03 
 
 
286 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  25.83 
 
 
563 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  22.99 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>