17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0532 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0002  hypothetical protein  30.86 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106351  normal  0.0651956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  25.29 
 
 
329 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3262  PRC-barrel domain-containing protein  23.76 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  20.66 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0002  hypothetical protein  26.25 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  24.16 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  22.78 
 
 
563 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  26.43 
 
 
159 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  21.85 
 
 
301 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  23.03 
 
 
360 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4122  hypothetical protein  22.37 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0216201 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00011  hypothetical protein  21.47 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.562889  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  29.91 
 
 
250 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00011  hypothetical protein  25.41 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00011  hypothetical protein  26.23 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00151751  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0002  hypothetical protein  19.26 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>