21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1421 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  97.11 
 
 
346 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  62.53 
 
 
361 aa  424  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  58.79 
 
 
360 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  63.31 
 
 
369 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  66.67 
 
 
354 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  58.1 
 
 
349 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  58.89 
 
 
351 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  59.66 
 
 
339 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  58.08 
 
 
355 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  53.39 
 
 
337 aa  239  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  42.81 
 
 
325 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  47.55 
 
 
378 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  48.54 
 
 
315 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  48.54 
 
 
318 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  48.8 
 
 
329 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  42.21 
 
 
319 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  44.29 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  25.95 
 
 
220 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  25.14 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>