26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0118 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
301 aa  595  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  36.4 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  36.52 
 
 
248 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  41.61 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  28.18 
 
 
563 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  28.92 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  32.12 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  28.65 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2564  hypothetical protein  30.91 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  27.85 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  34.96 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  26.14 
 
 
184 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  24.52 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  27.21 
 
 
178 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  25.95 
 
 
159 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  26.47 
 
 
157 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  28.68 
 
 
157 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  26.45 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  26.86 
 
 
369 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  21.85 
 
 
286 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2589  hypothetical protein  25.62 
 
 
143 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000783955  hitchhiker  0.00142136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  22.99 
 
 
360 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  25.14 
 
 
346 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  25.28 
 
 
339 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  22.99 
 
 
361 aa  42.7  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  22.22 
 
 
329 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>