18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3578 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  32.14 
 
 
184 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  27.85 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  29.07 
 
 
563 aa  75.1  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  28.85 
 
 
347 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  25.16 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  24.55 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  32.37 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  27.15 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  28.12 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  26.58 
 
 
259 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  27.46 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  53.9  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  25.49 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  28.85 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  23.57 
 
 
268 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  24.39 
 
 
250 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2564  hypothetical protein  25.17 
 
 
274 aa  43.9  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>