25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2256 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  76.55 
 
 
360 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  70.82 
 
 
369 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  60.53 
 
 
346 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  60.54 
 
 
346 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  59.3 
 
 
354 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  56.94 
 
 
349 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  56.2 
 
 
355 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  55.65 
 
 
351 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  56.56 
 
 
339 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  53.61 
 
 
337 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  44.67 
 
 
318 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  44.67 
 
 
315 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  41.21 
 
 
325 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  48.76 
 
 
378 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  45.81 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  39.7 
 
 
329 aa  196  6e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  40.51 
 
 
329 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  22.98 
 
 
349 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  24.16 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  24.58 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  25.83 
 
 
563 aa  46.2  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  22.99 
 
 
301 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 
970 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  24.86 
 
 
220 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>