20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1550 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  100 
 
 
378 aa  755    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  46.28 
 
 
315 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  46.01 
 
 
318 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  45 
 
 
319 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  43.01 
 
 
325 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  43.2 
 
 
329 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  44.68 
 
 
329 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  44 
 
 
337 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  48.76 
 
 
361 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  48.54 
 
 
360 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  46.76 
 
 
369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  47.55 
 
 
346 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  47.06 
 
 
346 aa  199  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  47.09 
 
 
349 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  47.09 
 
 
351 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  46.6 
 
 
355 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  47.76 
 
 
354 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  46.12 
 
 
339 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  25.9 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  24.84 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>