22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00701 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  695    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  96.06 
 
 
355 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  90.6 
 
 
349 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  75.5 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  58.89 
 
 
346 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  56.16 
 
 
361 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  58.29 
 
 
346 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  55.83 
 
 
360 aa  371  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  52.97 
 
 
369 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  59.05 
 
 
354 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  45.03 
 
 
337 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  48.1 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  49.03 
 
 
315 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  48.32 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  47.09 
 
 
378 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  48.54 
 
 
319 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  50.24 
 
 
329 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  46.38 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  29.05 
 
 
220 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  23.9 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  26.32 
 
 
259 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0002  hypothetical protein  26.46 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106351  normal  0.0651956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>