22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2044 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2044  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.774361  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2256  hypothetical protein  53.95 
 
 
361 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.681573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0424  hypothetical protein  48.12 
 
 
360 aa  271  8.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.668376  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03251  hypothetical protein  48.58 
 
 
369 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  61.24 
 
 
346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  61.24 
 
 
346 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  44.22 
 
 
318 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  44.22 
 
 
315 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00701  hypothetical protein  60.75 
 
 
351 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00671  hypothetical protein  61.21 
 
 
339 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0060  hypothetical protein  62.62 
 
 
349 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00691  hypothetical protein  60.28 
 
 
355 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  47.56 
 
 
325 aa  255  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00661  hypothetical protein  58.56 
 
 
354 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.693612  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  46.61 
 
 
329 aa  241  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1550  PRC-barrel  44.67 
 
 
378 aa  233  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0357  PRC-barrel domain protein  41.09 
 
 
319 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  39.94 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0398  hypothetical protein  23.27 
 
 
349 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.018855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  28.11 
 
 
220 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  27.12 
 
 
347 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0002  hypothetical protein  24.43 
 
 
290 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106351  normal  0.0651956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>