18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0002 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0002  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  579  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106351  normal  0.0651956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  30.86 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0002  hypothetical protein  30.1 
 
 
249 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1329  hypothetical protein  28.4 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.64643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0002  hypothetical protein  24.24 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00011  hypothetical protein  25.9 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00011  hypothetical protein  28.14 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.562889  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0002  hypothetical protein  27.74 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00011  hypothetical protein  30.33 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00151751  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00011  hypothetical protein  30.33 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00011  hypothetical protein  27.69 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.946647 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00011  hypothetical protein  23.56 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.680102  hitchhiker  0.00654314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4303  PRC-barrel domain protein  27.72 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4688  PRC-barrel  24.86 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0745  PRC-barrel domain-containing protein  24.86 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4099  PRC-barrel domain protein  22.41 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4138  PRC-barrel domain protein  22.41 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 
563 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>