27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1428 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  100 
 
 		 88 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  84.88 
 
 		 89 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  59.3 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  59.3 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  56.98 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  55.17 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  54.65 
 
 		 86 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  53.49 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  51.16 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  51.16 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  62.35 
 
 		 84 aa  90.1  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  50 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  47.5 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  63.16 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  63.16 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  47.5 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  50 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  44.94 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  42.31 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  56.58 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.07 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  38.64 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  38.64 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  40 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  32.47 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  30.43 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  30.38 
 
 		 84 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>