20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2540 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  78.02 
 
 		 91 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  57.78 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  48.35 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  46.15 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  37.66 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  32.97 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  36.26 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  36.26 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  31.52 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  31.52 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  36.49 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  32.5 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  39.13 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  38.96 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  34.44 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  32.84 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  30.43 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.7 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  32.89 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>