29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0741 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  100 
 
 		 87 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  64.47 
 
 		 80 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  55.56 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  56.25 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  52.33 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  55 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  48.28 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  54.22 
 
 		 84 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5124  photosystem I reaction center subunit PsaK  44.71 
 
 		 86 aa  73.6  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0293041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  43.53 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  52.63 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  44.58 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  52.63 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  42.17 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  44.58 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15351  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.72 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09531  photosystem I PsaK protein (subunit X)  34.48 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.437179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  34.48 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  36.78 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.63 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.63 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.33 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0867  photosystem I reaction center subunit X  53.25 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  36.36 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  32.43 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  31.25 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  42.19 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  32.47 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>