25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0875 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0875  photosystem I reaction center subunit X-like protein  100 
 
 
97 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000037404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2540  photosystem I reaction center subunit X-like protein  57.78 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3380  photosystem I reaction center subunit PsaK  59.21 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000108124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3379  photosystem I reaction center subunit PsaK  37.78 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000107099  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0469  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.33 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.141782  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0407  photosystem I reaction center subunit X  44 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0456  photosystem I reaction center subunit PsaK  45.33 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0364  photosystem I reaction center subunit PsaK  43.37 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2539  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1071  photosystem I reaction center subunit X  36.36 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0920  photosystem I reaction center  41.1 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4846  photosystem I reaction center subunit X  38.89 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0557  photosystem I reaction center subunit PsaK  37.18 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.38078  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1428  photosystem I reaction center subunit X  32.47 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.967058  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09891  photosystem I PsaK protein (subunit X)  37.5 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08541  photosystem I PsaK protein (subunit X)  33.33 
 
 
86 aa  42  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2445  photosystem I reaction center subunit X  36.84 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0288285  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09731  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.06 
 
 
86 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.438982 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0301  photosystem I PsaK protein (subunit X)  35.06 
 
 
86 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.332819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0741  photosystem I reaction center subunit PsaK  42.19 
 
 
87 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167381  normal  0.0747979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3921  photosystem I psaG/psaK protein  38.16 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.682205  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3207  photosystem I reaction center subunit X  36.56 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2914  photosystem I reaction center subunit X  36.56 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.028613  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0894  photosystem I PsaK protein (subunit X)  36.36 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09551  photosystem I PsaK protein (subunit X)  31.11 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0409099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>